Die derde film, Men in Black, is 'n vervolg op die beroemde Amerikaanse komedie. Tommy Lee Jones en Will Smith speel almal saam. Die regisseur is weer oorgeneem deur Barry Sonnenfeld, uitvoerende vervaardiger agter Steven Spielberg. Die film het op 23 Mei 2012 in bioskope begin.
Die rol van die negatiewe held word hierdie keer deur Jemaine Clement ingeneem, hy speel Boris. Dit is die misdadiger wat uit die Lunar-gevangenis ontsnap het. Hy brand van haat vir agent Kay, wat in Julie 1969 die skuldige gevang en hom sonder arm gelaat het. Toe Kay skielik agterkom dat Boris gevlug het, betuig hy baie spyt dat hy hom dan nie tydens sy arrestasie doodgemaak het nie. Daarna verdwyn die agent eenvoudig, en net sy maat Jay onthou dat hy bestaan het. Die res van die swart personeel dink dat Kay in 1969 met 'n misdadiger gesterf het.
Die enigste verklaring vir so 'n ommekeer van die werklikheid is 'n verandering in die verlede. Jay en Agent O besluit dat Boris daarby betrokke is. Dit word bevestig deur 'n ander gebeurtenis op kosmiese skaal - die inval in die aarde deur die Boris-ras. In die voormalige werklikheid was dit onmoontlik, aangesien Kay 'n beskermende toestel op die planeet genaamd "ArkNet" geïnstalleer het. Nou, in verband met die dood van die agent, 'n paar dekades gelede, het die aarde geen versperring van ruimtelike vyande gehad nie.
Jay ontdek dat Boris na die verlede gestuur is deur Jeffrey Price, 'n elektronikahandelaar wat 'n onwettige tydskakelaar in sy arsenaal gehad het. Die agent het geen ander keuse as om terug te reis in tyd om sy maat te red nie. En hy word onmiddellik deur die jong Kay in hegtenis geneem. Tydens ondervraging vertel Jay hom alles, en die toekomstige maat glo. Saam vind hulle die Arkanian Griffin, wat die ArkNet het. Nou gaan hulle drie voort en vertrek om beskerming op die maan te plaas. Maar op 'n vuurpyl word hulle deur die kolonel gearresteer. Nou word hy Jay se geheime bewaarder.
Vanaf hierdie oomblik ontwikkel gebeure vinnig. Die helde ontmoet twee Boris en 'n geveg volg. 'N Misdadiger uit die toekoms word in die vuurpylas gegooi, en die jong Boris word agterna gestuur. Beskerming vir die aarde is gevestig. En nou wil dit voorkom asof Jay se missie voltooi is, maar 'n jong misdadiger wat wonderbaarlik oorleef, verskyn. Die kolonel sterf, maar Boris word ook vernietig. En nou verskyn 'n nuwe karakter in die film. 'N Seuntjie klim uit die motor van die kolonel en begin na sy pa soek. Die agent herken homself. Jay keer terug na sy tyd en ontmoet Kay by die kafee. Alles het teruggegaan.
